你好，根据你的描述，如果公司已经发起了三方协议，并且你已经同意了，但是学校还没有通过，那么三方协议暂时还没有生效。如果超过了应约截止日期，学校还没有通过，那么三方协议可能会作废。建议你及时与学校沟通，了解学校的审批进度，并催促学校尽快完成审批。同时，你也可以与公司沟通，了解他们是否可以延长应约截止日期。希望我的回答对你有所帮助。