沈自所2室硕士待遇还是不错的，两年后的待遇可能会有所提升，具体要看你的工作表现和项目经验。发展前景还是比较好的，因为沈自所是国内知名的科研机构，有很多优秀的科研项目和资源。工作时长一般是正常的8小时工作制，偶尔可能会有加班的情况，但总体来说还是比较合理的。